Institut poseduje sledeće laboratorije:
- Semenska laboratorija
- Laboratorija za ispitivanje svojstava drveta
- Entomološka laboratorija
- Fitopatološka laboratorija
- Pedološka laboratorija
- Laboratorija za mikropropagaciju
- Laboratorija za molekularna istraživanja
- Laboratrija za dendrohronologiju
